Lynaë est une variante orthographique moderne, probablement influencée par la popularité croissante des prénoms se terminant en -a et enrichie par le tréma, qui apporte une note d'originalité graphique. Il n'est pas issu d'une racine étymologique ancienne unique, mais s'inscrit dans une dynamique créative contemporaine, croisant des sonorités proches de prénoms comme Lina (d'origine arabe signifiant 'jeune palmier' ou latine issue de 'linum') et des variantes bretonnes ou germaniques.